Potrącenie nienależnego wynagrodzenia kilka miesięcy po wypłacie a zgoda pracownika

Przy wypłacie wynagrodzenia z góry zgodnie z art. 39 ust. 3 Karty Nauczyciela występuje sytuacja, kiedy wynagrodzenie jest wypłacane w pełnej wysokości, a następnie pracownik (nauczyciel) zachoruje i przebywa na zwolnieniu lekarskim. Czy prawidłowe jest rozliczanie nieobecności nauczyciela w następnym miesiącu? Czy przy dłuższych zwolnieniach (zasiłek chorobowy, zasiłek macierzyński) też można tak robić (rozliczenie odłoży się w czasie do zakończenia zasiłku)?
Nauczycielka w ciąży poszła na zwolnienie lekarskie od 15 lutego 2011 r. W lipcu 2011 r. urodziła dziecko. W styczniu 2012 r. chce wrócić do pracy. Dnia 1 lutego 2011 r. dostała wypłatę za cały miesiąc, w marcu rozliczono zwolnienie chorobowe za luty i część za marzec, w kwietniu część z marca i część z kwietnia, w maju część kwietnia i część maja itd. Przy wypłacie za styczeń 2012 r. po powrocie nauczycielki zostanie do wypłaty część zasiłku macierzyńskiego za grudzień 2011 r. Czy można wynagrodzenie za styczeń 2012 r. pomniejszyć o nadpłacone wynagrodzenie z lutego 2011 r. i za te dni wypłacić zasiłek macierzyński? Czy potrzebna jest na to zgoda pracownika?