Choroba i urlop macierzyński a 50% koszty uzyskania przychodów

Pracuję w instytucie zatrudniającym pracowników naukowych i innych. Pracownikom naukowym z umowy o pracę z ustawy stosowane są koszty 50% w wymiarze 100% od wynagrodzenia podstawowego i składników od niego naliczanych (premii regulaminowej, dodatku stażowego), dodatku funkcyjnego oraz premii zadaniowej i za publikację, jak również nagród (bez nagrody jubileuszowej). Czy od nieobecności spowodowanej chorobą, urlopem macierzyńskim powinnam również stosować koszty 50% o wartości 100% pracownikom naukowym? Czy jednak koszty 50% naukowcom powinnam stosować od każdej wypłaconej kwoty bez względu na jej nazewnictwo? Czy u pracowników naukowych zasadne jest stosowanie kosztów uzyskania podstawowych (250 zł, 300 zł), jeżeli już stosuje pełne koszty w wysokości 50%?