Zaprzestanie wypłaty dodatku funkcyjnego a przeliczenie podstawy wynagrodzenia chorobowego

Pracownik od 1.04.2011 r. pełnił obowiązki sekretarza w urzędzie gminy, z wynagrodzeniem zasadniczym oraz dodatkiem funkcyjnym. W okresie od 19.05.2012 r. do 14.06.2012 r. przebywał na zwolnieniu lekarskim. Do podstawy wynagrodzenia chorobowego przyjęto wynagrodzenie za okres od maja 2011 r. do kwietnia 2012 r., wypłaconą nagrodę uznaniową oraz trzynastkę za 2011 r. Z dniem 31.05.2012 r. pracownikowi cofnięto powierzenie pełnienia obowiązków sekretarza. Pracownikowi od 1.06.2012 r. przysługuje wynagrodzenie niższe (sprzed okresu powierzenia mu obowiązków sekretarza)? Czy w związku z tym należy przeliczyć podstawę?