Spór powstał o to, czy istnieją podstawy do opodatkowania wartości pakietu medycznego w sytuacji, gdy pracownik w ogóle z niego nie skorzysta. Zdaniem większości urzędów skarbowych fakt ten pozostaje bez wpływu na sposób opodatkowania takiego świadczenia. Analogiczna sytuacja występuje - zdaniem organów podatkowych - w przypadku finansowania przez pracodawcę zakupu pracownikowi np. karty miejskiej lub innych biletów okresowych.

W sierpniu 2008 r. zapadł wyrok Wojewódzkiego Sądu Administracyjnego w Warszawie, który stwierdził, że opłacenie abonamentu nie powoduje, iż po stronie pracownika powstaje konkretne przysporzenie i dlatego nie trzeba od abonamentu opłacać podatku (wyrok WSA w Warszawie z 20 sierpnia 2008 r., III SA/Wa 625/08). Niestety nie jest to jedyne orzeczenie w tej sprawie, bowiem miesiąc wcześniej w tej samej sprawie wypowiedział się Wojewódzki Sąd Administracyjny we Wrocławiu… i miał na temat odmienne zdanie.

Co zatem ma zrobić pracodawca? Odpowiedź urzędników Izby Skarbowej w Warszawie jest następująca: od niekorzystnego wyroku złożona została kasacja, w związku z tym na razie na korzystne orzeczenie WSA pracodawcy nie mogą się powoływać. Na pytanie o to, co stanie się jeśli Sąd Najwyższy uzna, że od abonamentów nie trzeba opłacać podatku odpowiedź urzędów jest równie prosta - wyrok SN jest rozstrzygnięciem w konkretnej sprawie, a nie dotyczy każdej firmy… Co wiec pozostaje zrobić w takiej sytuacji? Przede wszystkim poczekać na rozstrzygniecie SN. Jeśli uzna on, że nie trzeba płacić podatku - wówczas każdy pracodawca będzie musiał wystąpić do właściwej izby skarbowej o interpretację, a po jej uzyskaniu ewentualnie odwołać się do sądu, …gdzie zapewne wygra.